AR+I participa en la publicació del genoma complert d’una papallona amenaçada d’extició
És el primer cop que tant la introducció com el resum de l’article científic d’una seqüenciació d’una espècie es fa en català
Investigadors d’Andorra i de Barcelona han aconseguit que des d’aquest divendres, 10 de gener, consti publicat en obert a l’àmbit científico acadèmic l’assemblatge complert del genoma de la papallona ‘coure violeta’ (Lycaena helle), una espècie amenaçada a nivell mundial i de la qual només es coneixen dues poblacions a la Península Ibèrica, una d’elles a Andorra. Hom calcula que la població andorrana de L. helle és només d’un parell de desenes d’individus. La seqüència completa dels cromosomes d’aquesta espècie està basada en un espècimen femella capturat al Principat per investigadors d’Andorra Recerca Innovació.
A part de la importància científica, perquè la seqüenciació del genoma d’una espècie amenaçada ajudarà a la seva conservació i a conèixer els seus mecanismes d’adaptació al canvi global, també destaca que aquesta és la primera espècie seqüenciada de la qual es pot consultat el resum i la introducció en català. Aquesta fita lingüística, pionera en l’àmbit científico acadèmic, ha estat possible perquè el català és la llengua vehicular a totes les entitats que han participat en aquesta investigació.
El genoma de L. helle ha estat seqüenciat en el marc de la iniciativa catalana per l’Earth Biogenome Project, la qual té com a objectiu produir un catàleg detallat del genoma d’espècies eucariotes als Països Catalans. I ha estat possible gràcies a la col·laboració com a part de la CBP (Catalan Biogenome Project) on han treballat les entitats CRG (Centre de Regulació Genòmica), el CNAG (Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica) i Andorra Recerca Innovació (AR+I) i amb el suport d’ERGA (European Reference Genome Atlas).
En aquest estudi s’ha generat un assemblatge del genoma d’alta qualitat i s’ha dut a terme la seqüenciació d’RNA amb metodologies de lectura llarga a partir de l’ala i la pota del mateix individu utilitzat per a la seqüenciació del genoma. Els resultats d’aquesta seqüenciació han estat utilitzats per produir una anotació gènica del genoma. També s’ha realitzat l’assemblatge del genoma mitocondrial, que té una mida de 15,5 kilobases. L’anotació d’aquest assemblatge ha identificat 20.122 gens que codifiquen per a proteïnes.
El coure violeta, Lycaena helle, és una espècie en perill d'extinció, de la categoria [CR - En Perill Crític] segons la llista vermella de lepidòpters d'Andorra. L'any 2024 es va aprovar, a proposta del ministre de Medi Ambient, Agricultura i Ramaderia, un pla de recuperació d'aquesta espècie, consultable al Decret 230/2024, del 29-5-2024. El pla de recuperació va ser redactat per investigadors del Museu de Ciències Naturals de Granollers amb la participació de l'AR+I.
Aquests plans de recuperació són possibles gràcies a projectes de seguiment a llarg termini com el programa BMSAnd, en vigència des de 2004.
Els enllaços de l’article:
Pladevall C, Caritg R, Cámara F et al. The genome sequence of the Violet Copper, Lycaena helle (Denis & Schiffermüller, 1775) [version 1; peer review: awaiting peer review]. F1000Research 2025, 14:60
Resum i introducció de l'article en català